Rencontres R 2023 - Avignon

Conférence
Date de publication

21 juin 2023

Les 9e Rencontres R ont eu lieu à Avignon du 21 au 23 juin 2023 (site web).

Conférenciers invités et conférencières invitées

Tutoriels

Programme des rencontres
auteurrices titre mots_cles
Christophe Dervieux De R Markdown à Quarto sans effort pour aller plus loin avec ses publications. quarto, rmarkdown, publication, reproductibilité
Antoine Bichat, Julie Aubert Créer un pipeline de machine learning complet avec {tidymodels} machine learning, statistiques, tidymodels
Kim Antunez, Etienne Côme Statspatial : Analyse spatiale et cartographie avec R Statistique spatiale, Cartographie
Aurélie Vache Tips pour combattre le syndrome de l'imposteur developpement personnel
Bastien Chassagnol, Etienne Becht, Gregory Nuel, Yufei Luo DeCovarT, a R package for a robust deconvolution of cell mixture in transcriptomic samples using a multivariate Gaussian generative framework cellular deconvolution, gLasso, generative model, bulk RNA Sequencing, Levenberg, Marquard, constrained optimisation
Jean Dupin CGI – Permettre à de nouveaux utilisateurs de R de créer des graphiques respectant les contraintes de son institut Package, Design, Visualisation
Thierry Faure, Loris Croce, Gil De Sousa Applications Shiny pour le suivi de systèmes agricoles et environementaux. application Shiny, IoT, traitement, visualisation et analyse de données
Lisa Nicvert, Hervé Fritz, Stéphane Dray Camtrapviz, une interface Shiny pour visualiser les données de pièges photographiques visualisation de données, Shiny, package R, écologie, pièges photographiques
Dan Chaltiel {crosstable} : décrivez vos datasets en quelques lignes Package – Statistique – épidémiologie – Biostatistique – Description – Data – Dataset
Vincent Guyader Comment bien rater votre forge logicielle R ? Infrastructure, Workbench
Amélie Vernay, Benjamin Charlier, Ghislain Durif, Chloé Serre-Combe RKeOps v2: Kernel operations with Symbolic Tensors on the GPU in R Kernel operations, Matrix reduction, GPU, Symbolic matrix operations, Computational statistics
Colin Fay MongoDB - J'suis pas venu ici pour souffrir, ok ? Package, Base de données, production, krav maga
Gabrielle Devaux Comment Shiny aide Enedis à contribuer à la transition énergétique pour les collectivités territoriales Statistique spatiale, Visualisation, Cartographie
Lise Vaudor, Maëlle Salmon glitter makes SPARQL: glitter, un package R pour explorer et collecter des données du web sémantique Web sémantique, Linked Open Data, RDF, SPARQL, Wikidata, tidyverse, Package
Simon Benateau Vigie-Analyse, des applications shiny pour les scol'R Statistique, Ecologie, Application shiny, data, Enseignement
Jean-François Rey {VMR} to manage Virtual Machines for/with R vagrant, virtual machines, gitlab
Pierre Santagostini, Nizar Bouhlel Packages mggd et mcauchyd – Distribution gaussienne généralisée multivariée, distribution de Cauchy multivariée Package, Loi gaussienne généralisée multivariée, Loi de Cauchy multivariée, Divergence de Kullback, Leibler
Loup Rimbaud, Julien Papaïx, Jean-François Rey, Marta Zafarroni, Marta Zafarroni Modelling plant resistance deployment: the R package {landsepi} Modélisation – Pathologie Végétale– Package
Colin Fay Welcome to the golemverse Package, shiny, production, golem
Xavier Delpuech Une application R Shiny pour la simulation du bilan hydrique des sols viticoles (modèle WaLIS) vigne, modélisation, contrainte hydrique, R, shiny
Nancy Rebout Enseigner les statistiques avec YouTube et la pop culture Programmation – statistiques – pédagogie – ludique
Luis Garcez R package for analyzing adverse drug reactions in FDA database: Evaluation of ALS patients adverse drug reactions Statistics, Pharmacology, Adverse Drug Reactions, Package, ALS
Marine Marjou, Marie Grosdidier, Charlotte Rüger, Pauline Bres {qdd} : un package R de nettoyage et de qualité des données pour les Plateformes d'Epidémiosurveillances data, package, qualité des données, nettoyage, épidémiologie, épidémiosurveillance
Olivier Delaigue, Guillaume Thirel, David Dorchies, Pierre Brigode airGRgalaxy : des outils hydrologiques autour des modèles GR Package, Hydrologie, Modélisation, Assimilation de données, Influences anthropiques, Enseignement
Elise Maigné, Isabelle Sanchez, David Carayon, Joseph Tran, Jean-François Rey SK8 : Un service institutionnel de gestion et d'hébergement d'applications Shiny R, Shiny, Web, Application, Devops, INRAE, Kubernetes, Docker, renv, CI/CD, Gitlab, service
Guilherme Mendoza Guimarães, Olivier Delaigue Développement d'une base de données hydro-climatiques nationale à l'aide de R Bassin versant, Hydrologie, Climatologie, Physiographie, Base de données
David Carayon, Sydney Girard, Frédéric Zahm IDEATools : Un package R pour évaluer la durabilité des exploitations agricoles avec la méthode IDEA4 R, Package, Dataviz, Reporting, INRAE, IDEA4, Agriculture, Durabilité
Nadia Bessoltane, Audrey Hulot, Gwendal Cueff, Christine Paysant - Le Roux, Delphine Charif RFLOMICS: Interactive web application for multi-omics data analysis Biostatistiques, omiques, Rshiny, Reproductibilité, package
Pascal Cristofoli, Bénédicte Garnier, Timothée Giraud, Elisabeth Morand Russ a 10 ans ... Sciences sociales, Ingenieure, Résilient, Histoire
Théo Grente, Valérie Girardin, Phillipe Regnault, Matthieu Dien Analyse de réseaux trophiques : comparaison d'algorithmes pour l'échantillonage uniforme de polytope Package, Biologie, Réseaux trophiques, Échantillonage uniforme, Méthodes MCMC, Modélisation Linéaire Inverse
Inchboard Lauren L'analyse de survie, une « nouvelle » méthode pour modéliser les dynamiques temporelles du dépérissement de la vigne épidémiologie, statistique, viticulture, maladies du bois, esca, survie
Arthur Bréant Le futur c'est SAS ! Euh. . . non, Sass ! Sass, Shiny, Stylisation, Productivité
Mohamed El Fodil Ihaddaden Ultra R : Comment écrire du code Ultra Efficient ? programmation, data, Package
Murielle Delmotte Initier 2400 personnes à R par enchantement : une histoire de licornes, potion et génie...logiciel Teamworks, Génie logiciel, devops, formation
Lino Galiana, Romain Avouac Diffuser la culture de la reproductibilité par une formation aux bonnes pratiques: de la qualité d'un projet aux pipelines de données Bonnes pratiques, Qualité, Packages, renv, Environnements virtuels, Pipelines, targets
Marie Vaugoyeau Où trouver de l'aide quand on apprend R ? apprentissage, reprex, rnewbies, débutant
Christophe Dervieux Se démarquer avec les thèmes HTML Quarto. quarto – rmarkdown – html – css – styles – publication – reproductibilité
Julien Chiquet, Chloé-Agathe Azencott, François David Collin, Ghislain Durif, Mathurin Massias, Pierre Neuvial, Nelle Varoquaux Computo: An academic journal promoting reproductibility via Quarto and Continuous Integration Reproducible research, Quarto, R, Python, Julia, Machine, Learning, Statistics
Valentin Cadoret, Victor Perrier Synthèse hebdomadaire de la consommation d'électricité française Consommation, Electricité, Visualisation, Rmarkdown, pandoc, bslib, blastula, httr2, plotly
Rhian Davies Data science without the data data science, data pipeline, development
Théodore Vanrenterghem ShinySbm : une application Shiny pour analyser des réseaux à l'aide de modèles à blocs stochastiques sbm – Shiny – Package – Données de Réseaux – Statistiques appliquées – Graphes – Écologie – Sociologie
Antoine Languillaume "AHHH #$@% ça marche pas !" : Aidez votre père dans sa lutte avec l'informatique et devenez un.e meilleur.e développeur.se Reproductibilité, Apprentissage, Interopérabilité R et Python, Conteneurisation, Chanson Française.
François-David Collin Pybind11/reticulate comme alternative à Rcpp Python, R, modern C++, Packages, Rcp
Antony Pudlicki, Olivier Bernard, Valéry Bourny, Geoffroy Berard, Olivier Durand-Drouhin SABRE (industrial project) R en contexte industriel
Youenn Drouet MyFamilyRisk: une application R/Shiny pour saisir facilement son histoire familiale de cancer. Oncogénétique, Application Shiny, Histoire familiale de cancer
Sébastien Rochette {golem} et {fusen}, le combo gagnant pour construire des applications Shiny robustes et faciles à maintenir Shiny, golem, fusen, package, workflow
Maxime Jaunatre, Georges Kunstler {matreex} : Simuler les dynamiques forestières européeennes Integral projection model, dynamique des populations, Biologie, ingénieur, Package
Mouna Belaid R-Ladies Paris, une communauté engagée garantissant la diversité et l'inclusivité RLadies, communauté, inclusivité, diversité, égalité
Régis Leroy 7 Méthodes secrètes des informaticiens pour mieux programmer Développement, Ingénierie, Bonnes pratiques
Andre Buskvekster R sur OpenBSD pare, feu, installation, configuration, sécurité, communauté, OpenBSD, pf, vmm, Docker, Rserve, tidyverse, RStudio, Posit, PostGIS
Frédéric Blanchard, Guillaume Dollé, Philippe Regnault meRoo : Un écosystème logiciel pour l'apprentissage des sciences des données installé sur un cluster de Raspberry Pi Enseignement, data science, workflow, cluster, Raspberry Pi.
Laurent Spanu, Fabian Lenartz Qualité de l'air ambiant en Wallonie (Belgique) - Visualisation des mesures de la pollution via une app' R-Shiny {golem} dans un environnement ShinyProxy sciences, qualité de l'air, data, visualisation, shiny, GitLab
Alexis Fribault Suivi de la réponse des agroécosystèmes au changement climatique. Visualisation sur une application R-Shiny Changement climatique, Shiny, biodiversité, agroécosystèmes
Joël Girès, Hugo Périlleux phacochr: un géocodeur pour les géocoder tous - Package R pour réaliser le géocodage d'adresses en Belgique Package, Géocodage, SIG, fuzzyjoin
Yan Holtz R dans l'univers de la Dataviz R, dataviz, d3.js, shiny, ggplot2
Dan Chaltiel {autoimport} : gérer l'enfer des imports Package, Statistiques, Documentation, roxygen2
David Gohel Réaliser ses tableaux avec flextable tableaux, reporting clinique, agrégations
Sarah Bauduin, Eliot Mcintire, Alex Chubaty La modélisation individu-centrée sur R avec le package NetLogoR Modélisation individu, centrée, Modélisation agent, centrée, NetLogoR, NetLogo, Package R
Terence Dechaux Combien d'animaux dans mon essai ? Statistique – Expérimentation – Echantillon – Tests statistiques – R – Shiny
Paul Carteron {happign} : une porte ouverte sur les données IGN Package, Data, Géospatiale
Alexis Van Straaten, Jean Feydy, Anne-Sophie Jannot survivalGPU : Analyses de survie sur cartes graphiques Package, analyses de survie, épidémiologie, biostatistique
David Gohel ggiraph et shiny ggplot2, reactive, interactive
Charlotte Cheinin Visualisations interactives de données au service de la prise de décision sur les études cliniques de phase précoce en oncologie RShiny – visualisation de données – statistique – étude clinique – multi cohortes – oncologie – prise de décision – GxP
Mickaël Carlos Utiliser R et Python pour le traitement de données : exploration des avantages de Python en matière de visualisation Data science – Python – R – Data Science – Dataviz – Interactivité
Hugues Pecout Rzine : pour la diffusion et le partage de ressources sur la pratique de R en SHS ressources, collection, notebook, Git, SHS
Guyliann Engels, Philippe Grosjean Application {shiny} de correction de projets individuels utilisant R, RStudio, GitHub Science des données biologiques, Application shiny, Pédagogie, Correction, Projet RStudio, GitHub, R Markdown
Philippe Grosjean fRench : R en français R, Traduction, Français, Public francophone, RStudio, data.io, chart
Cervan Girard Et si {shiny} n'existait pas. . . ? ingénierie, shiny, application web, back to the future
Arthur Bréant Construiriez-vous votre cuisine sans en avoir fait des plans ? Shiny, Méthode d'optimisation, Maquette, Figma
Antoine Languillaume {mariobox}: des APIs {plumber} à toute épreuve Ingénérie logicielle, API REST, framework, {plumber}
Christophe Regouby {tabnet} : Un package de deep-learning pour données tabulaires entièrement intégré à tidymodels Deep, learning, Données tabulaires, torch, IA, Package
Aymeric Stamm, Lise Bellanger, Laura Maria Sangalli, Piercesare Secchi, Simone Vantini fdacluster: Clustering for Functional Data functional data, amplitude & phase variability, hierarchical clustering, R package.
Alain Quartier-La-Tente Manipuler les moyennes mobiles avec R et JDemetra+ Statistique, séries temporelles, moyennes mobiles, package
Timothée Giraud L'écosystème spatial de R cartographie, analyse spatiale, SIG
Lise Vaudor Pastels, paillettes et packages pour accompagner la recherche avec R recherche, pédagogie, illustrations, shiny, package
Kim Antunez, Julien Pramil Lissage spatial avec le package btb Statistique spatiale, Carroyage, Lissage spatial, Statistiques urbaines, Datavisualisation
Marc Grossouvre, Didier Rullière, Jonathan Villot Quelle géostatistique pour des DPE à la localisation incertaine ? Géostatistique, climat, rénovation, multi, échelle, MAUP
Sébastien Coube Modèle hiérarchique de processus gaussien des plus proches voisins non stationnaire, multivarié, et non séparable, pour la modélisation des polluants atmosphériques Statistique bayésienne, Statistique spatiale : Markov chain Monte, Carlo, Pollution, Processus gaussien des plus proches voisins, Approximation de Vecchia, Nonstationarité, Nonséparabilité, Multivariabilité
Bruno André Rodrigues Coelho La reproductibilité avec R, ou pourquoi celle-ci est située sur un continuum reproductibilité, gestion des risques
Florence Mounier Faire un package R documenté, testé, versionné et intégré en quelques minutes ? Challenge accepted ! Package, workflow, {fusen}, RStudio, GitHub
Yohann Mansiaux {lozen}, le thermomix de vos projets de développement R Package, Gestion de projet, Github, Gitlab