Rencontres R 2013

workshop
Date de publication

27 juin 2013

Les 2e Rencontres R ont eu lieu à l’Université Claude Bernard Lyon 1 les 27 et 28 juin 2013 (site web).

Conférenciers invités

Programme des rencontres
auteurrices titre mots_cles
Hadley Wickham Visualising big data in R Visualisation, Big data
François Husson L'analyse de données avec FactoMineR : les nouveautés Analyse de données, module graphique, FactoMineR, données manquantes
Timothée Giraud rCarto, un package de cartographie statistique Géographie, Cartographie, Sémiologie graphique, Visualisation, Carte, Graphique
Aurélie Siberchicot, Alice Julien-Laferriere, Jean Thioulouse, Stéphane Dray adegraphics : un package pour la représentation et l'analyse de données multivariées Analyse multivariée, Graphique, Visualisation
Delphine Rieutort, Régis De Gaudemaris, Dominique Bicout Développement d'une application sous R pour la Surveillance Observationnelle des Problèmes de Santé au Travail maladies professionnelles, surveillance observationnelle, modélisation, programmation, logiciel R
Julien Clavel, Gildas Merceron, Gilles Escarguel Estimation des données manquantes en morphométrie : quelle limite choisir ? Imputations multiples, données manquantes, morphométrie, simulations, ordinations, superimpositions procrustes
Jeremie Zaffran, Carine Michel, Francoise Delbecq, Philippe Sautet Prédiction de la réactivité du glycérol sur les catalyseurs métalliques régression linéaire, prédiction, erreurs, boite à moustaches, catalyse, DFT
Kenneth Knoblauch What a statistician might want to know about human color vision, but was afraid to ask! visualisation, graphiques, couleur
Christophe Genolini, Jean-Baptiste Pingault, Bruno Falissard KmL3D: K-means pour données longitudinales jointes K, means, trajectoires jointes, partitionnement, interface graphique, graphes 3D dynamiques.
Amaury Labenne MFAMIX : une extension de l'analyse factorielle multiple pour des groupes de variables mixtes analyse factorielle multiple, méthode PCAMIX, analyse de la qualité de vie
Jean Thioulouse, Aurélie Siberchicot, Alice Julien Laferrière, Anne-Béatrice Dufour, Stéphane Dray Méthodes de couplage de deux K-tableaux et collections de graphiques Analyse de données, Ecologie, ade4
Frederico Caeiro aste: An R package for the adaptive estimation the right tail Extreme value index, semi, parametric estimation, bias reduction.
Nicolas Jung, Laurent Vallat, Seiamak Bahram, Maumy-Bertrand Myriam, Frédéric Bertrand Cascade : un package R pour étudier la dispersion d'un signal dans un réseau de gènes. Statistique, Biologie, Lasso, Réseau de régulation génique
Anaïs Rouanet, Carole Frindel, David Rousseau Corrélations entre maillages 3D au moyen du logiciel R application à l'imagerie par IRM de l'accident vasculaire cérébral Imagerie, Neuroscience, Corrélation
Anne Cheylus, Raphaël Fargier, Tatjana Nazir Corrélations entre signaux EEG : un code d'analyse parallélisé Statistiques, EEG, Corrélations, Test de permutations, Calcul parallèle
Florent Chuffart Parallel Computing in R using the Bot Package Distributed Computing, Bag of Tasks, Parameter Sweep
Van Trung Pham, Gildas Mazo Un package pour utiliser les Cumulative Distribution Networks Cumulative Distribution Networks, graphe, vraisemblance, fonction de répartition multivariée
Arthur Charpentier, Ewen Gallic Visualisation de processus spatiaux à l'aide de la correction de Ripley effets de bord, estimation par noyau, GIS, méthode de la circonférence de Ripley, polygones, processus spatiaux
Malika Madelin, Cyril Bonnefoy Visualisation et cartographie des données de capteurs météorologiques à l'échelle des terroirs viticoles web mapping, climatologie, vignoble
Karim Chine R and the Cloud Cloud Computing, EC2, e, Learning, distant education, e, Science, Collaboration, Science Gateways, Big data, Analytics, as, a, Service
Habib Saadi R2GUESS: a GPU-based R package for sparse Bayesian variable selection Biologie, Genomique, Bayesien, Selection de Variable, GPU, Statistiques en Grande Dimension.
Didier Chauveau, Pierre Vandekerkhove An R package using HPC for entropy estimation and MCMC evaluation Entropy estimation, High Performance Computing, Kullback divergence, MCMC algorithms, Nonparametric statistics, Rmpi
Romain Francois Intégration R et C++ avec Rcpp R, Rcpp, c++
Alexandre Laurent, Yassin Mazroui, Audrey Mauguen, Virginie Rondeau frailtypack : Un package pour l'analyse de données de survie corrélées Survie, Modèle à fragilité, Modèle conjoint, Evénements récurrents
Emmanuel Rousseaux, Gilbert Ritschard The Dataset Project: Handling survey data in R Survey, Data Management, Data processing, Data analysis, Panel Data.
Jeremie Riou Sample Size Determination and Data Analysis in the context of continuous co-primary endpoints in clinical trials. Sample Size Determination, Co, primary endpoints, Multiple testing, Clinical trials
Jérôme Sueur R as a sound system acoustique, son, audio, série temporelle, temps, fréquence
Yvonnick Noel L'approche par comparaison de modèles avec R2STATS dans l'enseignement des statistiques en sciences humaines Interfaces graphiques, GLM(M), facteur de Bayes, comparaison de modèles
Simon Penel, Stéphane Dray, Anne-Béatrice Dufour, Jean Lobry, Sylvain Mousset Un site web d'enseignement R automatisé et à gestion partagée Statistique, Biologie, Enseignement
Sylvain Mousset Génération automatique de documents pédagogiques avec R pour l'enseignement et l'évaluation des étudiants. Pédagogie, génération automatique de documents, questionnaires à choix multiples
Mehdi Khaneboubi Pistes de réflexion pour la mise en œuvre d'un enseignement à distance sur le test du khi carré d'indépendance pour des étudiants en master de sciences de l'éducation initiation, enseignements à distance, sciences de l'éducation, khi deux
Anne-Béatrice Dufour, Stéphane Dray, Jean Lobry, Jean Thioulouse De la biologie à l'algèbre linéaire ... en passant par R. Expérimenter la notion de projection. Enseignement, Biologie Humaine, Algèbre linéaire, Projection
Guillemette Marot, Florence Jaffrézic, Andrea Rau metaRNASeq: un package pour la méta-analyse de données RNASeq méta analyse, analyse différentielle, RNA seq, transcriptomique, séquençage haut débit
Morgane Pierre-Jean jointSeg : Segmentation de données génomiques en cancérologie Bioinformatique, CNV, Cancer, Nombre de copies, Fraction d'allèle B, biostatistique, détection de ruptures
Andrea Rau, Mélina Gallopin, Gilles Celeux, Florence Jaffrézic HTSFilter: An independent data-based filter for replicated high-throughput transcriptome sequencing experiments Independent filter, gene expression, RNA, seq, differential analysis
Joël Gombin Aspects de cartographie thématique pour les sciences sociales avec R Cartographie, Sciences sociales
Marie Laure Delignette-Muller, Christophe Dutang Nouvelles fonctionnalités du package fitdistrplus ajustement de distributions, bootstrap, données censurées
Benoit Lalloué, Séverine Deguen, Jean-Marie Monnez, Cindy Padilla, Wahida Kihal, Denis Zmirou-Navier, Nolwenn Le Meur SesIndexCreatoR : Un package R pour la création et la visualisation d'indices socioéconomiques Analyse en composantes principales, Classification Ascendante Hiérarchique, Statut socioéconomique
Pierre-Olivier Chasset PNN : une nouvelle bibliothèque R pour la modélisation d'un réseau de neurones probabilistes de Specht Réseau de neurones artificiels, Probabilité
Youenn Drouet, Valérie Bonadona, Christine Lasset Estimation des risques dans les formes familiales de cancer. Statistique en génétique, Données familiales, Risque de cancer.
Raphaël Nedellec Prévision de consommation électrique avec R Consommation électrique, GAM, modélisation
Jean-Olivier Irisson autoplot : ready-made plots with ggplot2 Visualisation, Versatility, Multivariate data analysis
Tiba Delespierre, Céline Piedvache, Jean-Michel Thurin, Monique Thurin, Bruno Falissard Des analyses exploratoires multidimensionnelles pour prédire la progression des patients en thérapie Analyse en Composantes Principales, ACP, Classification Ascendante Hiérarchique, CAH, RRFPP, psychothérapie, autisme, ECAR, EPCA, CPQ
Guillaume Kon Kam King, Philippe Veber, Marie Laure Delignette-Muller, Sandrine Charles R au secours des écotoxicologues interfaçage web, analyse de données de bioessais, distribution de sensibilité des espèces
Nehemie Strupler Analyse et datation d'artefacts archéolgiques: R et les cachets circulaires hittites Statistique, Archéologie, Chronologie
François Briatte, Ivaylo Petev Teaching R to social science undergraduates Statistiques, Enseignement, Sciences Humaines et Sociales
Julien Godet, Halina Anton, Yves Mely R tools for spatial point pattern analysis applied to fluorescence localization nanoscopy Nanoscopie, Imagerie, Statistiques Spatiales, R
Anne Gayet Traiter des données de tracking – navigation web, suivi d'enquête – avec R séquences d'événements, règles d'association, motifs séquentiels, coclustering, trajectoires, données de tracking, webmining
Jean-Paul Maalouf, Sandrine Longis, Séverine Montaudouin, Caroline Vieuille, Gilles Le Pape Rendre R plus accessible aux utilisateurs non-informaticiens convivialité, débutants, interfaces graphiques, non informaticiens, R Commander, synthèse
Gilbert Ritschard TraMineR : Une boite à outils pour l'exploration et la visualisation de séquences séquences, trajectoires, séquences d'états, séquences d'événements, visualisation, dissimilarités, analyse basée sur les dissimilarités
Viviane Philipps, Cécile Proust-Lima multlcmm : fonction d'estimation de modèles mixtes à processus latent pour données longitudinales modèles mixtes multivariés, processus latent, données longitudinales
Cécile Sauder, Hervé Cardot Prédiction d'un événement binaire à partir de données fonctionnelles : Application aux bovins laitiers Prédiction, régression logistique, données fonctionnelles
Djeneba Thiam, Gregory Nuel Données tronquées sous R dans les modèles linéaires simples et à effets mixtes Données tronquées, modèle Tobit, modèles mixtes, algorithme EM
Quentin Grimonprez, Julien Jacques, Christophe Biernacki Rankclust: An R package for clustering multivariate partial rankings model, based clustering, multivariate ranking, partial ranking
Laura Bendhaïba, Madalina Olteanu, Nathalie Villa-Vialaneix SOMbrero: Cartes auto-organisatrices stochastiques pour l'intégration de données décrites par des tableaux de dissimilarités classification, visualisation, carte auto, organisatrice, données non euclidiennes, dissimilarité
Matthieu Cornec, Jean Das Nieves The data.sample package: sampling as a big data mining tool Big Data, sampling
David Gohel, Jean-François Collin Génération de documents Word à partir de R : utilisation du package R2DOCX dans une plateforme statistique en milieu industriel. reporting, word, rapport
Damien Leroux, Nathalie Villa-Vialaneix sexy-rgtk: a package for programming RGtk2 GUI in a user-friendly manner Gtk2, RGtk2, GUI
Rémy Drouilhet R-dyndoc une alternative à Sweave Génération de rapport automatique